Ada beberapa faktor yang diduga berperan dalam pengembangan infeksi usus pada diri seseorang, berikut di antaranya:
Jenis parasit yang menyebabkan infeksi usus antara lain Entamoeba histolytica dan Balantidium coli. Parasit ini umumnya menyebar melalui air, misalnya akibat berenang di kolam renang umum serta minum air dari sumur atau tangki air yang terkontaminasi.
Cytomegalovirus merupakan salah satu jenis virus penyebab infeksi usus. Virus ini umumnya menyebar melalui kontak dengan air liur dan urine penderita, atau melalui transfusi darah.
Jamur Candida hidup di dalam usus dalam jumlah yang terkendali. Namun, jika berkembang terlalu banyak, jamur ini dapat menyebabkan infeksi usus.
Beberapa jenis bakteri yang dapat menyebabkan infeksi usus adalah: E. coli, Shigella, Salmonella, Campylobacter, Clostridium, Yersinia, Seseorang dapat terinfeksi bakteri tersebut jika mengonsumsi makanan, seperti telur dan daging, yang tidak dimasak matang atau mengonsumsi air yang terkontaminasi. mengonsumsi makanan, seperti telur dan daging, yang tidak dimasak matang atau mengonsumsi air yang terkontaminasi.